Das Museum für Franken auf der Festung Marienberg birgt auf einer Ausstellungsfläche von 5 400 m² eine Fülle bedeutender Kunstwerke fränkischer und in Franken tätiger Künstler und Kunsthandwerker.

Der 1904 erbaute Getreidespeicher am Alten Hafen, funktionsgerecht modernisiert, bildet seit 2002 einen spannungsvollen Rahmen für zwei Kunstsammlungen und wechselnde Ausstellungen. Einen Bogen von der Romantik über die klassische Moderne bis hin zur Gegenwart spannt die städtische Sammlung, zu der auch der Nachlass Emy Roeder gehört. Die international bedeutende "Sammlung Peter C. Ruppert - Konkrete Kunst in Europa nach 1945" umfasst Werke von rund 227 Künstlerinnen und Künstlern aus 22 europäischen Ländern. In ihrer Qualität und Vielfalt repräsentiert sie das gesamte Spektrum dieser Kunstströmung.

Im Ostflügel der Festung Marienberg befinden sich die fürstbischöflichen Wohnräume, die Schatzkammer und eine Abteilung zur Stadtgeschichte Würzburgs.

Das Museum am Dom präsentiert auf 1 800 m² etwa 300 Kunstwerke, die ein Jahrtausend umspannen. Die grundlegend neue Konzeption des Museums stellt „alte“ und „neue“ Kunst gegenüber. So treffen z. B. Werke von Tilman Riemenschneider und Johann Peter Wagner auf Arbeiten von Ernst Barlach, Käthe Kollwitz und Joseph Beuys, aber auch Wolfgang Mattheuer und Werner Tübke.

Im ehemaligen Domherrenhof Marmelstein sind etwa 130 Objekte des Domschatzes vom 11. bis zum 20. Jahrhundert zu sehen. Grabbeigaben, Plastiken und Goldschmiedearbeiten sowie Textilien geben einen Einblick in die reiche Geschichte des Würzburger Domes.

Röntgen-Gedächtnisstätte des Röntgen-Kuratoriums Würzburg e. V. hier entdeckte Prof. Dr. Wilhelm Conrad Röntgen 1895 diese sensationellen Strahlen, denen er den Namen X-Strahlen gab. Die Röntgen-Gedächtnisstätte gewährt dem Besucher einen Einblick in die experimentelle Physik des ausgehenden 19. Jahrhunderts und zeigt neben der Entdeckungsapparatur einen Kathodenstrahlversuch - der Basis dieser Entdeckung war - ebenso wie einen Durchleuchtungsversuch mit X-Strahlen und den historischen Hörsaal Röntgens.

Gemäldegalerie, Antikensammlung und Graphische Sammlung. Das Martin von Wagner Museum ist seit 1963 im Südflügel der Fürstbischöflichen Residenz untergebracht. Die 1832 gegründete Sammlung der Universität Würzburg erweiterte sich durch die umfangreiche Stiftung Martin von Wagners (1777-1858), der als Maler, Bildhauer und Kunstagent König Ludwig I. in Rom lebte, zu einem der größten Universitätsmuseen Europas, das deshalb heute den Namen des Stifters trägt.

Ständige Sammlung und Wechselausstellungen u. a. mit Exponaten aus dem Nachlass des Würzburger Japanforschers Philipp F. v. Siebold. Original Japanisches Teehaus.

Auf der Basis des weltweit größten Fundes mittelalterlicher jüdischer Grabsteine findet man, modern dargestellt, Informationen über traditionelles jüdisches Leben in Würzburg bis in die Gegenwart.

Das Johanna-Stahl-Zentrum für jüdische Geschichte und Kultur in Unterfranken wird gemeinsam von der Stadt Würzburg und dem Bezirk Unterfranken getragen.

Das Mineralogische Museum blickt auf über 200 Jahre Sammlungsgeschichte zurück, durch großzügige Schenkungen und Ankäufe erlangte es im Laufe der Zeit immer mehr an Bedeutung.

Das Missionsmuseum ist im Turm der Herz-Jesu-Kirche des Pius-Seminars der Mariannhiller Missionare in drei Stockwerken eingerichtet. Ausgestellt sind Zeugnisse aus der Anfangszeit der Missionstätigkeit im Süden Afrikas, die vom Trappistenkloster Mariannhill in der Nähe der Hafenstadt Durban ihren Anfang nahm, und von der Mariannhiller Missionskongregation weitergeführt wurde.

Das Museum besteht im Wesentlichen aus dem historischen Sonderzug, der bei Sonderfahrten bzw. Ausstellungen und Bahnhofsfesten in Würzburg und der Region besichtigt werden kann. Weiterhin ist auch Teil der musealen Ausstattung die Werkstatt "Obere Wagenhalle" in Würzburg-Zell, in der die Fahrzeuge gewartet, restauriert und hierbei alte, heute nicht mehr gebräuchliche handwerkliche Traditionen gepflegt werden.

Gleich neben der Heidingsfelder Stadtmauer und dem Turm, bietet das Brauchtums- und Trachtenpuppenmuseum ein erhaltenswertes Stück Banater Herkunft und Erbe, das in die neue Heimat Deutschland herübergerettet wurde.

Das Historische Archiv der WVV befindet sich in der Ständerbühlstraße im Turm der Gebäudegruppe im ehemaligen Gaswerk. Der Turm beherbergt auf fünf Stockwerken die Archiv- und Museumsräume der WVV. Ausgestellt werden Bilder und Exponate über 150 Jahre Firmengeschichte.

Begegnung mit zeitgenössischer fränkischer Kunst und Kunsthandwerk, offen für Neues, Tradition bewahrend. Ort für Konzerte, Lesungen, Performances, Vorträge, Theater, Vernissagen, kulinarische Erfahrungen, Feste, Lebensart. Im Zentrum der Kulturstadt an der Alten Mainbrücke.

Auf der Suche nach Ausstellungsräumen entdeckten die Mitglieder des Kunstvereins Würzburg den stillgelegten Frachtkahn MS „IRIS“. Nach Renovierung und umfangreichen Umbauten in seinem Inneren entstand (1995) die „schwimmende Galerie“ des Kunstvereins, das KUNSTSCHIFF „ARTE NOAH“.

Das Künstlerhaus Würzburg ist der einzige Ort in Würzburg, wo originale Druckgrafik in einer öffentlichen Werkstatt entsteht. Die fachkundige Begleitung der Werkstattleiterin ermöglicht druckgrafisches Arbeiten sowohl als Laie als auch als erfahrener Druckgrafiker. Gemeinsames Arbeiten, Lernen und Fachsimpeln sowie regelmäßige Ausstellungen stehen im Vordergrund und bilden die Basis für einen angeregten Austausch über Kunst und Kultur.

Von klassischer Eleganz bis zu avantgardistischem Pfiff - ob topaktuelles Leinwandbild oder edel gerahmte Graphik - die Kollektion umfasst das ganze Spektrum zeitgemäßer Einrichtungswünsche.

Im Ausstellungsraum werden zeitgenössische Gold- und Silberschmiedearbeiten, vornehmlich aus eigenem Atelier sowie auch von befreundeten Künstlern gezeigt.

"immagis" ist eine Galerie für internationale Fotokunst und repräsentiert international ausgezeichnete Topfotografen. Es werden wechselnde Ausstellungen gezeigt sowie das Jahr über diverse Veranstaltungen organisiert.

Es werden Malerei, Photographie, Plastik und Objekte mit dem Schwerpunkt auf Unikaten gezeigt.

Ausstellungen im Bereich der Klassischen Moderne bis hin zur zeitgenössischen Kunst.  Durch entsprechende Kontakte gab es in der Vergangenheit verschiedene Werkschauen (Joan Miro, Gruppe ZERO, Jean Cocteau & Veit Relin, A. Paul Weber, Professor Klaus Fußmann, Victor Vasarely, Wolfgang Zelmer, Christo & Jeanne Claude, Janosch).

Kunst und Kommunikation ist das Motto im Atelier von Silvia Dolata. Hier wird gemalt und präsentiert. Eigene und auch Werke anderer Künstler.

Galerie für zeitgenössische Kunst. In drei bis vier Ausstellungen pro Jahr werden außergewöhnliche Künstlerinnen und Künstler präsentiert. Diese stammen höchstens ausnahmsweise aus dem Würzburger Dunstkreis, vielmehr aber aus ganz Deutschland und dem benachbarten Ausland, insbesondere aus Frankreich.

Das Ausstellungsprogramm der Galerie bezieht sich auf die Bereiche klassische Moderne und zeitgenössische Kunst des 20./21. Jahrhunderts. Ölbilder, Aquarelle und Graphik internationaler Künstler bestimmen das Angebot. Die Zusammenarbeit mit Museen, Kulturinstitutionen oder privaten Sammlern zeigt, dass es immer wieder neue Gelegenheiten gibt, sich Kunstwerke zu erschließen.

Ende 2003 richtete der WuF e. V., das Würzburger Schwulenzentrum, in seinen Vereinsräumen eine feste Galerie ein. Seitdem werden monatlich wechselnde Ausstellungen gezeigt.

Das Kunsthaus Michel, seit über 40 Jahren in der Semmelstraße, zeigt in regelmäßigen Abständen Arbeiten zeitgenössischer Künstler. Darüber hinaus ist das Kunsthaus Veranstalter musealer Ausstellungen.

Seit über 300 Jahren (Gründungsurkunde von 1696) besitzt Würzburg einen "Hortus Botanicus", welcher damit der älteste Botanische Garten Bayerns ist. Der Garten ermöglicht eine "Weltreise" durch die verschiedenen Klima- und Vegetationszonen unserer Erde.

Viermal im Jahr lädt die IHK Würzburg-Schweinfurt Künstlerinnen und Künstler ein, ihre Werke in den hauseigenen Räumen zu präsentieren. Die Ausstellungen, die sich zu einem renommierten Kunstforum entwickelt haben, stehen im Zeichen der Standortförderung, denn die Unterstützung von Würzburgs Kulturszene dient dazu, die Stadt und ihr schönes Umland für Unternehmen und die Mitarbeiter attraktiv zu machen.

Ausgestellte Objekte: Modell des Ringplatzes von Trautenau. Heimatgeschichtliche Literatur, Trachten, Stiche, Landkarten, Gebrauchsgegenstände, Sportgeräte, Modelle; Arbeiten des Bildhauers Schwantner; Modell des Etrich Taube; Archivs des Turngaues Trautenau.